Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc84Q4VA36 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc84Q4VA36 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc84Q4VA36 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc84Q4VA36 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc84Q4VA36 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc84Q4VA36 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc84Q4VA36 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc84Q4VA36 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc84Q4VA36 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc84Q4VA36 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc84Q4VA36 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc84Q4VA36 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc84Q4VA36 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc84Q4VA36 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc84Q4VA36 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc84Q4VA36 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc84Q4VA36 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc84Q4VA36 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc84Q4VA36 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc84Q4VA36 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc84Q4VA36 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc84Q4VA36 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc84Q4VA36 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc84Q4VA36 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc84Q4VA36 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc84Q4VA36 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc84Q4VA36 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc84Q4VA36 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc84Q4VA36 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc84Q4VA36 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc84Q4VA36 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc84Q4VA36 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc84Q4VA36 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc84Q4VA36 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc84Q4VA36 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc84Q4VA36 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc84Q4VA36 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc84Q4VA36 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc84Q4VA36 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc84Q4VA36 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc84Q4VA36 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc84Q4VA36 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc84Q4VA36 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc84Q4VA36 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc84Q4VA36 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc84Q4VA36 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc84Q4VA36 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc84Q4VA36 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc84Q4VA36 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc84Q4VA36 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc84Q4VA36 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc84Q4VA36 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc84Q4VA36 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc84Q4VA36 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc84Q4VA36 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc84Q4VA36 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc84Q4VA36 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc84Q4VA36 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc84Q4VA36 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc84Q4VA36 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc84Q4VA36 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc84Q4VA36 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc84Q4VA36 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc84Q4VA36 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc84Q4VA36 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc84Q4VA36 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc84Q4VA36 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc84Q4VA36 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc84Q4VA36 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc84Q4VA36 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc84Q4VA36 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc84Q4VA36 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc84Q4VA36 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc84Q4VA36 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc84Q4VA36 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc84Q4VA36 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc84Q4VA36 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc84Q4VA36 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc84Q4VA36 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc84Q4VA36 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc84Q4VA36 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc84Q4VA36 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc84Q4VA36 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc84Q4VA36 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc84Q4VA36 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms