Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc3lQ4KL14 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc3lQ4KL14 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc3lQ4KL14 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc3lQ4KL14 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc3lQ4KL14 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc3lQ4KL14 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc3lQ4KL14 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc3lQ4KL14 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc3lQ4KL14 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc3lQ4KL14 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc3lQ4KL14 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc3lQ4KL14 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc3lQ4KL14 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc3lQ4KL14 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc3lQ4KL14 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc3lQ4KL14 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc3lQ4KL14 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc3lQ4KL14 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc3lQ4KL14 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc3lQ4KL14 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc3lQ4KL14 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc3lQ4KL14 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc3lQ4KL14 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc3lQ4KL14 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc3lQ4KL14 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc3lQ4KL14 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc3lQ4KL14 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc3lQ4KL14 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trappc3lQ4KL14 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trappc3lQ4KL14 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc3lQ4KL14 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc3lQ4KL14 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc3lQ4KL14 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc3lQ4KL14 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc3lQ4KL14 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc3lQ4KL14 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc3lQ4KL14 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc3lQ4KL14 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc3lQ4KL14 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc3lQ4KL14 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc3lQ4KL14 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc3lQ4KL14 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc3lQ4KL14 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc3lQ4KL14 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc3lQ4KL14 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc3lQ4KL14 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms