Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZF3

Ddx49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx49Q4FZF3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddx49Q4FZF3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddx49Q4FZF3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddx49Q4FZF3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddx49Q4FZF3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddx49Q4FZF3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ddx49Q4FZF3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddx49Q4FZF3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddx49Q4FZF3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddx49Q4FZF3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddx49Q4FZF3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddx49Q4FZF3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddx49Q4FZF3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddx49Q4FZF3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddx49Q4FZF3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx49Q4FZF3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx49Q4FZF3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx49Q4FZF3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx49Q4FZF3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx49Q4FZF3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx49Q4FZF3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx49Q4FZF3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddx49Q4FZF3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddx49Q4FZF3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddx49Q4FZF3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddx49Q4FZF3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddx49Q4FZF3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddx49Q4FZF3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddx49Q4FZF3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx49Q4FZF3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx49Q4FZF3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx49Q4FZF3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx49Q4FZF3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx49Q4FZF3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx49Q4FZF3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx49Q4FZF3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx49Q4FZF3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx49Q4FZF3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx49Q4FZF3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx49Q4FZF3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx49Q4FZF3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx49Q4FZF3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx49Q4FZF3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx49Q4FZF3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx49Q4FZF3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx49Q4FZF3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddx49Q4FZF3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddx49Q4FZF3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddx49Q4FZF3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddx49Q4FZF3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddx49Q4FZF3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddx49Q4FZF3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddx49Q4FZF3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddx49Q4FZF3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddx49Q4FZF3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms