Protein–RNA interactions for Protein: Q499E0

Brinp3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp3Q499E0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Brinp3Q499E0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Brinp3Q499E0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Brinp3Q499E0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Brinp3Q499E0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Brinp3Q499E0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Brinp3Q499E0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Brinp3Q499E0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Brinp3Q499E0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Brinp3Q499E0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Brinp3Q499E0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Brinp3Q499E0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Brinp3Q499E0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Brinp3Q499E0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Brinp3Q499E0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Brinp3Q499E0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Brinp3Q499E0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Brinp3Q499E0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Brinp3Q499E0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Brinp3Q499E0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Brinp3Q499E0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Brinp3Q499E0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Brinp3Q499E0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Brinp3Q499E0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Brinp3Q499E0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Brinp3Q499E0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Brinp3Q499E0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Brinp3Q499E0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Brinp3Q499E0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Brinp3Q499E0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Brinp3Q499E0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Brinp3Q499E0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Brinp3Q499E0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Brinp3Q499E0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Brinp3Q499E0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Brinp3Q499E0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Brinp3Q499E0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Brinp3Q499E0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Brinp3Q499E0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Brinp3Q499E0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Brinp3Q499E0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Brinp3Q499E0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Brinp3Q499E0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Brinp3Q499E0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Brinp3Q499E0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Brinp3Q499E0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Brinp3Q499E0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Brinp3Q499E0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Brinp3Q499E0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Brinp3Q499E0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Brinp3Q499E0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Brinp3Q499E0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Brinp3Q499E0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Brinp3Q499E0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Brinp3Q499E0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Brinp3Q499E0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Brinp3Q499E0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Brinp3Q499E0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Brinp3Q499E0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Brinp3Q499E0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Brinp3Q499E0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Brinp3Q499E0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Brinp3Q499E0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Brinp3Q499E0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Brinp3Q499E0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Brinp3Q499E0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Brinp3Q499E0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Brinp3Q499E0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Brinp3Q499E0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Brinp3Q499E0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Brinp3Q499E0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Brinp3Q499E0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Brinp3Q499E0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Brinp3Q499E0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Brinp3Q499E0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Brinp3Q499E0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Brinp3Q499E0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Brinp3Q499E0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Brinp3Q499E0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Brinp3Q499E0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Brinp3Q499E0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Brinp3Q499E0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Brinp3Q499E0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Brinp3Q499E0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Brinp3Q499E0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Brinp3Q499E0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Brinp3Q499E0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Brinp3Q499E0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Brinp3Q499E0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Brinp3Q499E0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Brinp3Q499E0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Brinp3Q499E0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Brinp3Q499E0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Brinp3Q499E0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Brinp3Q499E0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Brinp3Q499E0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Brinp3Q499E0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Brinp3Q499E0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Brinp3Q499E0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Brinp3Q499E0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms