Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Foxn3Q499D0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Foxn3Q499D0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Foxn3Q499D0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Foxn3Q499D0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxn3Q499D0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxn3Q499D0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxn3Q499D0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxn3Q499D0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxn3Q499D0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxn3Q499D0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxn3Q499D0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxn3Q499D0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxn3Q499D0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxn3Q499D0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxn3Q499D0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxn3Q499D0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxn3Q499D0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxn3Q499D0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxn3Q499D0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxn3Q499D0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxn3Q499D0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxn3Q499D0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxn3Q499D0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxn3Q499D0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxn3Q499D0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxn3Q499D0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxn3Q499D0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxn3Q499D0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxn3Q499D0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxn3Q499D0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Foxn3Q499D0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Foxn3Q499D0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Foxn3Q499D0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Foxn3Q499D0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Foxn3Q499D0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Foxn3Q499D0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Foxn3Q499D0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxn3Q499D0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms