Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ulk4Q3V129 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ulk4Q3V129 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ulk4Q3V129 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ulk4Q3V129 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ulk4Q3V129 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ulk4Q3V129 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ulk4Q3V129 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ulk4Q3V129 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ulk4Q3V129 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ulk4Q3V129 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ulk4Q3V129 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ulk4Q3V129 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ulk4Q3V129 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ulk4Q3V129 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ulk4Q3V129 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ulk4Q3V129 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ulk4Q3V129 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ulk4Q3V129 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ulk4Q3V129 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ulk4Q3V129 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ulk4Q3V129 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ulk4Q3V129 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ulk4Q3V129 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ulk4Q3V129 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ulk4Q3V129 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ulk4Q3V129 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ulk4Q3V129 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ulk4Q3V129 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ulk4Q3V129 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ulk4Q3V129 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ulk4Q3V129 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ulk4Q3V129 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ulk4Q3V129 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ulk4Q3V129 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ulk4Q3V129 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ulk4Q3V129 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ulk4Q3V129 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms