Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc110Q3V125 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc110Q3V125 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc110Q3V125 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms