Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnah12Q3V0Q1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnah12Q3V0Q1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnah12Q3V0Q1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnah12Q3V0Q1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnah12Q3V0Q1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnah12Q3V0Q1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnah12Q3V0Q1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnah12Q3V0Q1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnah12Q3V0Q1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnah12Q3V0Q1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnah12Q3V0Q1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnah12Q3V0Q1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnah12Q3V0Q1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnah12Q3V0Q1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnah12Q3V0Q1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnah12Q3V0Q1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnah12Q3V0Q1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnah12Q3V0Q1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnah12Q3V0Q1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnah12Q3V0Q1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnah12Q3V0Q1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnah12Q3V0Q1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnah12Q3V0Q1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Dnah12Q3V0Q1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Dnah12Q3V0Q1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Dnah12Q3V0Q1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnah12Q3V0Q1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnah12Q3V0Q1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnah12Q3V0Q1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnah12Q3V0Q1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnah12Q3V0Q1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnah12Q3V0Q1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnah12Q3V0Q1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnah12Q3V0Q1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnah12Q3V0Q1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnah12Q3V0Q1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnah12Q3V0Q1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnah12Q3V0Q1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnah12Q3V0Q1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnah12Q3V0Q1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnah12Q3V0Q1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnah12Q3V0Q1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnah12Q3V0Q1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnah12Q3V0Q1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnah12Q3V0Q1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnah12Q3V0Q1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnah12Q3V0Q1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnah12Q3V0Q1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnah12Q3V0Q1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnah12Q3V0Q1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnah12Q3V0Q1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnah12Q3V0Q1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnah12Q3V0Q1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnah12Q3V0Q1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnah12Q3V0Q1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnah12Q3V0Q1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dnah12Q3V0Q1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dnah12Q3V0Q1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dnah12Q3V0Q1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dnah12Q3V0Q1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dnah12Q3V0Q1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnah12Q3V0Q1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnah12Q3V0Q1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnah12Q3V0Q1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnah12Q3V0Q1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnah12Q3V0Q1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnah12Q3V0Q1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnah12Q3V0Q1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnah12Q3V0Q1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnah12Q3V0Q1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnah12Q3V0Q1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnah12Q3V0Q1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnah12Q3V0Q1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnah12Q3V0Q1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnah12Q3V0Q1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnah12Q3V0Q1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnah12Q3V0Q1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnah12Q3V0Q1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnah12Q3V0Q1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnah12Q3V0Q1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnah12Q3V0Q1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnah12Q3V0Q1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnah12Q3V0Q1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnah12Q3V0Q1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnah12Q3V0Q1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnah12Q3V0Q1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnah12Q3V0Q1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnah12Q3V0Q1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnah12Q3V0Q1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnah12Q3V0Q1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnah12Q3V0Q1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnah12Q3V0Q1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnah12Q3V0Q1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnah12Q3V0Q1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnah12Q3V0Q1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnah12Q3V0Q1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnah12Q3V0Q1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnah12Q3V0Q1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnah12Q3V0Q1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms