Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc114Q3UX62 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc114Q3UX62 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc114Q3UX62 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc114Q3UX62 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc114Q3UX62 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc114Q3UX62 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc114Q3UX62 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc114Q3UX62 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc114Q3UX62 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.8 ms