Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fchsd2Q3USJ8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fchsd2Q3USJ8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fchsd2Q3USJ8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fchsd2Q3USJ8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fchsd2Q3USJ8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fchsd2Q3USJ8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fchsd2Q3USJ8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fchsd2Q3USJ8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fchsd2Q3USJ8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fchsd2Q3USJ8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fchsd2Q3USJ8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fchsd2Q3USJ8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fchsd2Q3USJ8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fchsd2Q3USJ8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fchsd2Q3USJ8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fchsd2Q3USJ8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fchsd2Q3USJ8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fchsd2Q3USJ8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fchsd2Q3USJ8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fchsd2Q3USJ8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fchsd2Q3USJ8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fchsd2Q3USJ8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fchsd2Q3USJ8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Fchsd2Q3USJ8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Fchsd2Q3USJ8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Fchsd2Q3USJ8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fchsd2Q3USJ8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Fchsd2Q3USJ8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fchsd2Q3USJ8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fchsd2Q3USJ8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fchsd2Q3USJ8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fchsd2Q3USJ8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fchsd2Q3USJ8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fchsd2Q3USJ8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fchsd2Q3USJ8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fchsd2Q3USJ8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fchsd2Q3USJ8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fchsd2Q3USJ8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fchsd2Q3USJ8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fchsd2Q3USJ8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fchsd2Q3USJ8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fchsd2Q3USJ8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fchsd2Q3USJ8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fchsd2Q3USJ8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fchsd2Q3USJ8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fchsd2Q3USJ8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fchsd2Q3USJ8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fchsd2Q3USJ8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fchsd2Q3USJ8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fchsd2Q3USJ8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fchsd2Q3USJ8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fchsd2Q3USJ8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fchsd2Q3USJ8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fchsd2Q3USJ8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fchsd2Q3USJ8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fchsd2Q3USJ8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fchsd2Q3USJ8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fchsd2Q3USJ8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fchsd2Q3USJ8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fchsd2Q3USJ8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fchsd2Q3USJ8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fchsd2Q3USJ8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fchsd2Q3USJ8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fchsd2Q3USJ8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fchsd2Q3USJ8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fchsd2Q3USJ8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fchsd2Q3USJ8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Fchsd2Q3USJ8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fchsd2Q3USJ8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Fchsd2Q3USJ8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fchsd2Q3USJ8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fchsd2Q3USJ8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fchsd2Q3USJ8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Fchsd2Q3USJ8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fchsd2Q3USJ8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fchsd2Q3USJ8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Fchsd2Q3USJ8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fchsd2Q3USJ8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fchsd2Q3USJ8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fchsd2Q3USJ8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fchsd2Q3USJ8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fchsd2Q3USJ8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Fchsd2Q3USJ8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fchsd2Q3USJ8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fchsd2Q3USJ8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fchsd2Q3USJ8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fchsd2Q3USJ8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fchsd2Q3USJ8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fchsd2Q3USJ8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fchsd2Q3USJ8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Fchsd2Q3USJ8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Fchsd2Q3USJ8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fchsd2Q3USJ8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fchsd2Q3USJ8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fchsd2Q3USJ8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fchsd2Q3USJ8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms