Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm28047Q3US59 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm28047Q3US59 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm28047Q3US59 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm28047Q3US59 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm28047Q3US59 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm28047Q3US59 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm28047Q3US59 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm28047Q3US59 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm28047Q3US59 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm28047Q3US59 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm28047Q3US59 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm28047Q3US59 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm28047Q3US59 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm28047Q3US59 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm28047Q3US59 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm28047Q3US59 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm28047Q3US59 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm28047Q3US59 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm28047Q3US59 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm28047Q3US59 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm28047Q3US59 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm28047Q3US59 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm28047Q3US59 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm28047Q3US59 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm28047Q3US59 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm28047Q3US59 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm28047Q3US59 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm28047Q3US59 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm28047Q3US59 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm28047Q3US59 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm28047Q3US59 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms