Protein–RNA interactions for Protein: Q3URD3

Slmap, Sarcolemmal membrane-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlmapQ3URD3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SlmapQ3URD3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SlmapQ3URD3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SlmapQ3URD3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SlmapQ3URD3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SlmapQ3URD3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SlmapQ3URD3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SlmapQ3URD3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SlmapQ3URD3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SlmapQ3URD3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SlmapQ3URD3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SlmapQ3URD3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SlmapQ3URD3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SlmapQ3URD3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SlmapQ3URD3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SlmapQ3URD3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SlmapQ3URD3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SlmapQ3URD3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SlmapQ3URD3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SlmapQ3URD3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SlmapQ3URD3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SlmapQ3URD3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SlmapQ3URD3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SlmapQ3URD3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SlmapQ3URD3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SlmapQ3URD3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SlmapQ3URD3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SlmapQ3URD3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SlmapQ3URD3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SlmapQ3URD3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SlmapQ3URD3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SlmapQ3URD3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SlmapQ3URD3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SlmapQ3URD3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SlmapQ3URD3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SlmapQ3URD3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SlmapQ3URD3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SlmapQ3URD3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SlmapQ3URD3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SlmapQ3URD3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SlmapQ3URD3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SlmapQ3URD3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms