Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQS8

Rbm20, RNA-binding protein 20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm20Q3UQS8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbm20Q3UQS8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbm20Q3UQS8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbm20Q3UQS8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbm20Q3UQS8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbm20Q3UQS8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbm20Q3UQS8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rbm20Q3UQS8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Rbm20Q3UQS8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rbm20Q3UQS8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rbm20Q3UQS8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbm20Q3UQS8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms