Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQI9

Mindy4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy4Q3UQI9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mindy4Q3UQI9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mindy4Q3UQI9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mindy4Q3UQI9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mindy4Q3UQI9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mindy4Q3UQI9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mindy4Q3UQI9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mindy4Q3UQI9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mindy4Q3UQI9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mindy4Q3UQI9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mindy4Q3UQI9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mindy4Q3UQI9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mindy4Q3UQI9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mindy4Q3UQI9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mindy4Q3UQI9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mindy4Q3UQI9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mindy4Q3UQI9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mindy4Q3UQI9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mindy4Q3UQI9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mindy4Q3UQI9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mindy4Q3UQI9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mindy4Q3UQI9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mindy4Q3UQI9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Mindy4Q3UQI9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mindy4Q3UQI9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mindy4Q3UQI9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mindy4Q3UQI9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mindy4Q3UQI9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mindy4Q3UQI9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mindy4Q3UQI9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mindy4Q3UQI9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mindy4Q3UQI9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mindy4Q3UQI9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mindy4Q3UQI9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mindy4Q3UQI9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mindy4Q3UQI9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mindy4Q3UQI9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Mindy4Q3UQI9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mindy4Q3UQI9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mindy4Q3UQI9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mindy4Q3UQI9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mindy4Q3UQI9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mindy4Q3UQI9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mindy4Q3UQI9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mindy4Q3UQI9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mindy4Q3UQI9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mindy4Q3UQI9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mindy4Q3UQI9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mindy4Q3UQI9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mindy4Q3UQI9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mindy4Q3UQI9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mindy4Q3UQI9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mindy4Q3UQI9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mindy4Q3UQI9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mindy4Q3UQI9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mindy4Q3UQI9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mindy4Q3UQI9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mindy4Q3UQI9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mindy4Q3UQI9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mindy4Q3UQI9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mindy4Q3UQI9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mindy4Q3UQI9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mindy4Q3UQI9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mindy4Q3UQI9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mindy4Q3UQI9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mindy4Q3UQI9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mindy4Q3UQI9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mindy4Q3UQI9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mindy4Q3UQI9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mindy4Q3UQI9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mindy4Q3UQI9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mindy4Q3UQI9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mindy4Q3UQI9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mindy4Q3UQI9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mindy4Q3UQI9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mindy4Q3UQI9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mindy4Q3UQI9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mindy4Q3UQI9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mindy4Q3UQI9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mindy4Q3UQI9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mindy4Q3UQI9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mindy4Q3UQI9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mindy4Q3UQI9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mindy4Q3UQI9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mindy4Q3UQI9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mindy4Q3UQI9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mindy4Q3UQI9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mindy4Q3UQI9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mindy4Q3UQI9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mindy4Q3UQI9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mindy4Q3UQI9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms