Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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