Protein–RNA interactions for Protein: Q3UME2

Tmem241, Transmembrane protein 241, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem241Q3UME2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem241Q3UME2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms