Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMB9

Washc4, WASH complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc4Q3UMB9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Washc4Q3UMB9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Washc4Q3UMB9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Washc4Q3UMB9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Washc4Q3UMB9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Washc4Q3UMB9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Washc4Q3UMB9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Washc4Q3UMB9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Washc4Q3UMB9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Washc4Q3UMB9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Washc4Q3UMB9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Washc4Q3UMB9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Washc4Q3UMB9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Washc4Q3UMB9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms