Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cops9Q3U898 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cops9Q3U898 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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