Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tbc1d2bQ3U0J8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tbc1d2bQ3U0J8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tbc1d2bQ3U0J8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tbc1d2bQ3U0J8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tbc1d2bQ3U0J8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tbc1d2bQ3U0J8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tbc1d2bQ3U0J8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tbc1d2bQ3U0J8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tbc1d2bQ3U0J8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tbc1d2bQ3U0J8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tbc1d2bQ3U0J8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tbc1d2bQ3U0J8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tbc1d2bQ3U0J8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tbc1d2bQ3U0J8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tbc1d2bQ3U0J8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tbc1d2bQ3U0J8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tbc1d2bQ3U0J8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tbc1d2bQ3U0J8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tbc1d2bQ3U0J8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tbc1d2bQ3U0J8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tbc1d2bQ3U0J8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tbc1d2bQ3U0J8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tbc1d2bQ3U0J8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tbc1d2bQ3U0J8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tbc1d2bQ3U0J8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tbc1d2bQ3U0J8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tbc1d2bQ3U0J8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tbc1d2bQ3U0J8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tbc1d2bQ3U0J8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tbc1d2bQ3U0J8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tbc1d2bQ3U0J8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tbc1d2bQ3U0J8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tbc1d2bQ3U0J8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tbc1d2bQ3U0J8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tbc1d2bQ3U0J8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tbc1d2bQ3U0J8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tbc1d2bQ3U0J8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tbc1d2bQ3U0J8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tbc1d2bQ3U0J8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tbc1d2bQ3U0J8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tbc1d2bQ3U0J8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tbc1d2bQ3U0J8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tbc1d2bQ3U0J8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tbc1d2bQ3U0J8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tbc1d2bQ3U0J8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tbc1d2bQ3U0J8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tbc1d2bQ3U0J8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tbc1d2bQ3U0J8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tbc1d2bQ3U0J8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tbc1d2bQ3U0J8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tbc1d2bQ3U0J8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tbc1d2bQ3U0J8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tbc1d2bQ3U0J8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tbc1d2bQ3U0J8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tbc1d2bQ3U0J8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tbc1d2bQ3U0J8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tbc1d2bQ3U0J8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24■■□□□ 1.43
Tbc1d2bQ3U0J8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tbc1d2bQ3U0J8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Tbc1d2bQ3U0J8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tbc1d2bQ3U0J8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tbc1d2bQ3U0J8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tbc1d2bQ3U0J8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tbc1d2bQ3U0J8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tbc1d2bQ3U0J8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tbc1d2bQ3U0J8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tbc1d2bQ3U0J8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tbc1d2bQ3U0J8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tbc1d2bQ3U0J8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tbc1d2bQ3U0J8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tbc1d2bQ3U0J8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tbc1d2bQ3U0J8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tbc1d2bQ3U0J8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tbc1d2bQ3U0J8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tbc1d2bQ3U0J8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tbc1d2bQ3U0J8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tbc1d2bQ3U0J8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tbc1d2bQ3U0J8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tbc1d2bQ3U0J8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tbc1d2bQ3U0J8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tbc1d2bQ3U0J8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tbc1d2bQ3U0J8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tbc1d2bQ3U0J8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tbc1d2bQ3U0J8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms