Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT99

Gdpd4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd4Q3TT99 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gdpd4Q3TT99 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gdpd4Q3TT99 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gdpd4Q3TT99 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gdpd4Q3TT99 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gdpd4Q3TT99 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdpd4Q3TT99 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdpd4Q3TT99 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdpd4Q3TT99 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdpd4Q3TT99 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdpd4Q3TT99 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdpd4Q3TT99 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdpd4Q3TT99 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdpd4Q3TT99 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdpd4Q3TT99 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdpd4Q3TT99 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdpd4Q3TT99 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdpd4Q3TT99 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdpd4Q3TT99 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdpd4Q3TT99 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdpd4Q3TT99 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdpd4Q3TT99 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdpd4Q3TT99 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gdpd4Q3TT99 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gdpd4Q3TT99 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gdpd4Q3TT99 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gdpd4Q3TT99 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gdpd4Q3TT99 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gdpd4Q3TT99 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gdpd4Q3TT99 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gdpd4Q3TT99 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gdpd4Q3TT99 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gdpd4Q3TT99 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gdpd4Q3TT99 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gdpd4Q3TT99 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gdpd4Q3TT99 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gdpd4Q3TT99 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gdpd4Q3TT99 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gdpd4Q3TT99 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gdpd4Q3TT99 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gdpd4Q3TT99 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gdpd4Q3TT99 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gdpd4Q3TT99 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gdpd4Q3TT99 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gdpd4Q3TT99 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gdpd4Q3TT99 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gdpd4Q3TT99 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gdpd4Q3TT99 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gdpd4Q3TT99 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms