Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctdnep1Q3TP92 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctdnep1Q3TP92 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctdnep1Q3TP92 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctdnep1Q3TP92 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctdnep1Q3TP92 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctdnep1Q3TP92 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctdnep1Q3TP92 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctdnep1Q3TP92 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctdnep1Q3TP92 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctdnep1Q3TP92 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctdnep1Q3TP92 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctdnep1Q3TP92 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctdnep1Q3TP92 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctdnep1Q3TP92 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctdnep1Q3TP92 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctdnep1Q3TP92 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctdnep1Q3TP92 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctdnep1Q3TP92 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctdnep1Q3TP92 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctdnep1Q3TP92 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctdnep1Q3TP92 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctdnep1Q3TP92 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctdnep1Q3TP92 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctdnep1Q3TP92 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctdnep1Q3TP92 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctdnep1Q3TP92 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctdnep1Q3TP92 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctdnep1Q3TP92 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctdnep1Q3TP92 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctdnep1Q3TP92 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctdnep1Q3TP92 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctdnep1Q3TP92 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctdnep1Q3TP92 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctdnep1Q3TP92 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctdnep1Q3TP92 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctdnep1Q3TP92 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctdnep1Q3TP92 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctdnep1Q3TP92 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctdnep1Q3TP92 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctdnep1Q3TP92 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctdnep1Q3TP92 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctdnep1Q3TP92 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctdnep1Q3TP92 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ctdnep1Q3TP92 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctdnep1Q3TP92 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctdnep1Q3TP92 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctdnep1Q3TP92 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctdnep1Q3TP92 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctdnep1Q3TP92 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctdnep1Q3TP92 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctdnep1Q3TP92 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctdnep1Q3TP92 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctdnep1Q3TP92 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctdnep1Q3TP92 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctdnep1Q3TP92 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctdnep1Q3TP92 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctdnep1Q3TP92 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctdnep1Q3TP92 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctdnep1Q3TP92 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctdnep1Q3TP92 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctdnep1Q3TP92 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctdnep1Q3TP92 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctdnep1Q3TP92 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctdnep1Q3TP92 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctdnep1Q3TP92 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctdnep1Q3TP92 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctdnep1Q3TP92 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctdnep1Q3TP92 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctdnep1Q3TP92 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctdnep1Q3TP92 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctdnep1Q3TP92 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctdnep1Q3TP92 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctdnep1Q3TP92 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctdnep1Q3TP92 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctdnep1Q3TP92 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctdnep1Q3TP92 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctdnep1Q3TP92 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctdnep1Q3TP92 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctdnep1Q3TP92 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctdnep1Q3TP92 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctdnep1Q3TP92 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctdnep1Q3TP92 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctdnep1Q3TP92 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctdnep1Q3TP92 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctdnep1Q3TP92 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctdnep1Q3TP92 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctdnep1Q3TP92 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctdnep1Q3TP92 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133 ms