Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc102aQ3TMW1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms