Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
H2afvQ3THW5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
H2afvQ3THW5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2afvQ3THW5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2afvQ3THW5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
H2afvQ3THW5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2afvQ3THW5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2afvQ3THW5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2afvQ3THW5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2afvQ3THW5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2afvQ3THW5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2afvQ3THW5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2afvQ3THW5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2afvQ3THW5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2afvQ3THW5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2afvQ3THW5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2afvQ3THW5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2afvQ3THW5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
H2afvQ3THW5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2afvQ3THW5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2afvQ3THW5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2afvQ3THW5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2afvQ3THW5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2afvQ3THW5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2afvQ3THW5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2afvQ3THW5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
H2afvQ3THW5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2afvQ3THW5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2afvQ3THW5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2afvQ3THW5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2afvQ3THW5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2afvQ3THW5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2afvQ3THW5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2afvQ3THW5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2afvQ3THW5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2afvQ3THW5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2afvQ3THW5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2afvQ3THW5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2afvQ3THW5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2afvQ3THW5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2afvQ3THW5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2afvQ3THW5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2afvQ3THW5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2afvQ3THW5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2afvQ3THW5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2afvQ3THW5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2afvQ3THW5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms