Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBE6

Pi4k2a, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pi4k2aQ2TBE6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pi4k2aQ2TBE6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pi4k2aQ2TBE6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pi4k2aQ2TBE6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pi4k2aQ2TBE6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pi4k2aQ2TBE6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pi4k2aQ2TBE6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pi4k2aQ2TBE6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pi4k2aQ2TBE6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pi4k2aQ2TBE6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms