Protein–RNA interactions for Protein: Q2MH31

Smrp1, Spermatid-specific manchette-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smrp1Q2MH31 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smrp1Q2MH31 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smrp1Q2MH31 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smrp1Q2MH31 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smrp1Q2MH31 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smrp1Q2MH31 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smrp1Q2MH31 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smrp1Q2MH31 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smrp1Q2MH31 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smrp1Q2MH31 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smrp1Q2MH31 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smrp1Q2MH31 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smrp1Q2MH31 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smrp1Q2MH31 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smrp1Q2MH31 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smrp1Q2MH31 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smrp1Q2MH31 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smrp1Q2MH31 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smrp1Q2MH31 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smrp1Q2MH31 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smrp1Q2MH31 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smrp1Q2MH31 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smrp1Q2MH31 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smrp1Q2MH31 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smrp1Q2MH31 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smrp1Q2MH31 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smrp1Q2MH31 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smrp1Q2MH31 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smrp1Q2MH31 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smrp1Q2MH31 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smrp1Q2MH31 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smrp1Q2MH31 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smrp1Q2MH31 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smrp1Q2MH31 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smrp1Q2MH31 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smrp1Q2MH31 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smrp1Q2MH31 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smrp1Q2MH31 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smrp1Q2MH31 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smrp1Q2MH31 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smrp1Q2MH31 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smrp1Q2MH31 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smrp1Q2MH31 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smrp1Q2MH31 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms