Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm1123Q1RME4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm1123Q1RME4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm1123Q1RME4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm1123Q1RME4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm1123Q1RME4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm1123Q1RME4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm1123Q1RME4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm1123Q1RME4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm1123Q1RME4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm1123Q1RME4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm1123Q1RME4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm1123Q1RME4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm1123Q1RME4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm1123Q1RME4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm1123Q1RME4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm1123Q1RME4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm1123Q1RME4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm1123Q1RME4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm1123Q1RME4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm1123Q1RME4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm1123Q1RME4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm1123Q1RME4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm1123Q1RME4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm1123Q1RME4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm1123Q1RME4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm1123Q1RME4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm1123Q1RME4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm1123Q1RME4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm1123Q1RME4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm1123Q1RME4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm1123Q1RME4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm1123Q1RME4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm1123Q1RME4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm1123Q1RME4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm1123Q1RME4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm1123Q1RME4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm1123Q1RME4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm1123Q1RME4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm1123Q1RME4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm1123Q1RME4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm1123Q1RME4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm1123Q1RME4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm1123Q1RME4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm1123Q1RME4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm1123Q1RME4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm1123Q1RME4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm1123Q1RME4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms