Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cers3Q1A3B0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cers3Q1A3B0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Cers3Q1A3B0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cers3Q1A3B0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Cers3Q1A3B0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cers3Q1A3B0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cers3Q1A3B0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cers3Q1A3B0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cers3Q1A3B0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cers3Q1A3B0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cers3Q1A3B0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cers3Q1A3B0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cers3Q1A3B0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cers3Q1A3B0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cers3Q1A3B0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cers3Q1A3B0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cers3Q1A3B0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Cers3Q1A3B0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cers3Q1A3B0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cers3Q1A3B0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cers3Q1A3B0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cers3Q1A3B0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cers3Q1A3B0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cers3Q1A3B0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cers3Q1A3B0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cers3Q1A3B0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cers3Q1A3B0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cers3Q1A3B0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cers3Q1A3B0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cers3Q1A3B0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cers3Q1A3B0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cers3Q1A3B0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cers3Q1A3B0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cers3Q1A3B0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cers3Q1A3B0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cers3Q1A3B0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cers3Q1A3B0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cers3Q1A3B0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cers3Q1A3B0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cers3Q1A3B0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cers3Q1A3B0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cers3Q1A3B0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cers3Q1A3B0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cers3Q1A3B0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cers3Q1A3B0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cers3Q1A3B0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cers3Q1A3B0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cers3Q1A3B0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cers3Q1A3B0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cers3Q1A3B0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cers3Q1A3B0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cers3Q1A3B0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cers3Q1A3B0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cers3Q1A3B0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cers3Q1A3B0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Cers3Q1A3B0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cers3Q1A3B0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cers3Q1A3B0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cers3Q1A3B0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cers3Q1A3B0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cers3Q1A3B0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cers3Q1A3B0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cers3Q1A3B0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cers3Q1A3B0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cers3Q1A3B0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cers3Q1A3B0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cers3Q1A3B0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cers3Q1A3B0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cers3Q1A3B0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cers3Q1A3B0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cers3Q1A3B0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cers3Q1A3B0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cers3Q1A3B0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Cers3Q1A3B0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cers3Q1A3B0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cers3Q1A3B0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cers3Q1A3B0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cers3Q1A3B0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cers3Q1A3B0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cers3Q1A3B0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cers3Q1A3B0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cers3Q1A3B0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cers3Q1A3B0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cers3Q1A3B0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cers3Q1A3B0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cers3Q1A3B0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cers3Q1A3B0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cers3Q1A3B0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cers3Q1A3B0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cers3Q1A3B0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cers3Q1A3B0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cers3Q1A3B0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cers3Q1A3B0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cers3Q1A3B0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cers3Q1A3B0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cers3Q1A3B0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cers3Q1A3B0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cers3Q1A3B0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cers3Q1A3B0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms