Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Traf3ip1Q149C2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Traf3ip1Q149C2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Traf3ip1Q149C2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Traf3ip1Q149C2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Traf3ip1Q149C2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Traf3ip1Q149C2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Traf3ip1Q149C2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Traf3ip1Q149C2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Traf3ip1Q149C2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Traf3ip1Q149C2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Traf3ip1Q149C2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Traf3ip1Q149C2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Traf3ip1Q149C2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Traf3ip1Q149C2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Traf3ip1Q149C2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Traf3ip1Q149C2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Traf3ip1Q149C2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Traf3ip1Q149C2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Traf3ip1Q149C2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Traf3ip1Q149C2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Traf3ip1Q149C2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Traf3ip1Q149C2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Traf3ip1Q149C2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Traf3ip1Q149C2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Traf3ip1Q149C2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Traf3ip1Q149C2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Traf3ip1Q149C2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Traf3ip1Q149C2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Traf3ip1Q149C2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Traf3ip1Q149C2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Traf3ip1Q149C2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Traf3ip1Q149C2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Traf3ip1Q149C2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Traf3ip1Q149C2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Traf3ip1Q149C2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Traf3ip1Q149C2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Traf3ip1Q149C2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Traf3ip1Q149C2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Traf3ip1Q149C2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Traf3ip1Q149C2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Traf3ip1Q149C2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Traf3ip1Q149C2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Traf3ip1Q149C2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Traf3ip1Q149C2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Traf3ip1Q149C2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Traf3ip1Q149C2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Traf3ip1Q149C2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Traf3ip1Q149C2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Traf3ip1Q149C2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Traf3ip1Q149C2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Traf3ip1Q149C2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Traf3ip1Q149C2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Traf3ip1Q149C2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Traf3ip1Q149C2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Traf3ip1Q149C2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Traf3ip1Q149C2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Traf3ip1Q149C2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Traf3ip1Q149C2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Traf3ip1Q149C2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Traf3ip1Q149C2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Traf3ip1Q149C2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Traf3ip1Q149C2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Traf3ip1Q149C2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Traf3ip1Q149C2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Traf3ip1Q149C2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Traf3ip1Q149C2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Traf3ip1Q149C2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Traf3ip1Q149C2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Traf3ip1Q149C2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Traf3ip1Q149C2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Traf3ip1Q149C2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Traf3ip1Q149C2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Traf3ip1Q149C2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Traf3ip1Q149C2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Traf3ip1Q149C2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Traf3ip1Q149C2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Traf3ip1Q149C2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Traf3ip1Q149C2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Traf3ip1Q149C2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Traf3ip1Q149C2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Traf3ip1Q149C2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Traf3ip1Q149C2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Traf3ip1Q149C2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Traf3ip1Q149C2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Traf3ip1Q149C2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Traf3ip1Q149C2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Traf3ip1Q149C2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Traf3ip1Q149C2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
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