Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VgfQ0VGU4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VgfQ0VGU4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VgfQ0VGU4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VgfQ0VGU4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VgfQ0VGU4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VgfQ0VGU4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
VgfQ0VGU4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VgfQ0VGU4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VgfQ0VGU4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VgfQ0VGU4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VgfQ0VGU4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VgfQ0VGU4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VgfQ0VGU4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VgfQ0VGU4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
VgfQ0VGU4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VgfQ0VGU4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VgfQ0VGU4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VgfQ0VGU4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VgfQ0VGU4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VgfQ0VGU4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VgfQ0VGU4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VgfQ0VGU4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VgfQ0VGU4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VgfQ0VGU4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VgfQ0VGU4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VgfQ0VGU4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VgfQ0VGU4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VgfQ0VGU4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VgfQ0VGU4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VgfQ0VGU4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VgfQ0VGU4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VgfQ0VGU4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
VgfQ0VGU4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VgfQ0VGU4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VgfQ0VGU4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VgfQ0VGU4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VgfQ0VGU4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VgfQ0VGU4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VgfQ0VGU4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VgfQ0VGU4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VgfQ0VGU4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VgfQ0VGU4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VgfQ0VGU4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VgfQ0VGU4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VgfQ0VGU4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VgfQ0VGU4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VgfQ0VGU4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VgfQ0VGU4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VgfQ0VGU4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VgfQ0VGU4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VgfQ0VGU4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VgfQ0VGU4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VgfQ0VGU4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VgfQ0VGU4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VgfQ0VGU4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VgfQ0VGU4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VgfQ0VGU4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VgfQ0VGU4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VgfQ0VGU4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VgfQ0VGU4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VgfQ0VGU4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VgfQ0VGU4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
VgfQ0VGU4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VgfQ0VGU4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VgfQ0VGU4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VgfQ0VGU4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VgfQ0VGU4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VgfQ0VGU4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VgfQ0VGU4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VgfQ0VGU4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VgfQ0VGU4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VgfQ0VGU4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VgfQ0VGU4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VgfQ0VGU4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VgfQ0VGU4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
VgfQ0VGU4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VgfQ0VGU4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VgfQ0VGU4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VgfQ0VGU4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VgfQ0VGU4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VgfQ0VGU4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VgfQ0VGU4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VgfQ0VGU4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VgfQ0VGU4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VgfQ0VGU4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VgfQ0VGU4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VgfQ0VGU4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VgfQ0VGU4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VgfQ0VGU4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VgfQ0VGU4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VgfQ0VGU4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VgfQ0VGU4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VgfQ0VGU4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VgfQ0VGU4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VgfQ0VGU4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VgfQ0VGU4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VgfQ0VGU4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VgfQ0VGU4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
VgfQ0VGU4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms