Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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Ttc39dQ0VF76 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
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Ttc39dQ0VF76 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Ttc39dQ0VF76 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ttc39dQ0VF76 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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Ttc39dQ0VF76 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc39dQ0VF76 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc39dQ0VF76 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc39dQ0VF76 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc39dQ0VF76 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc39dQ0VF76 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc39dQ0VF76 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc39dQ0VF76 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc39dQ0VF76 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc39dQ0VF76 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc39dQ0VF76 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc39dQ0VF76 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc39dQ0VF76 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc39dQ0VF76 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc39dQ0VF76 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc39dQ0VF76 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc39dQ0VF76 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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Ttc39dQ0VF76 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc39dQ0VF76 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc39dQ0VF76 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc39dQ0VF76 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc39dQ0VF76 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc39dQ0VF76 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc39dQ0VF76 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc39dQ0VF76 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc39dQ0VF76 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc39dQ0VF76 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc39dQ0VF76 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc39dQ0VF76 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc39dQ0VF76 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc39dQ0VF76 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc39dQ0VF76 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc39dQ0VF76 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc39dQ0VF76 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc39dQ0VF76 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc39dQ0VF76 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc39dQ0VF76 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms