Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBP7

Shisal1, Protein shisa-like-1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal1Q0VBP7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisal1Q0VBP7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisal1Q0VBP7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms