Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL1

Tigd2, Tigger transposable element-derived protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd2Q0VBL1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tigd2Q0VBL1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tigd2Q0VBL1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tigd2Q0VBL1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tigd2Q0VBL1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tigd2Q0VBL1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tigd2Q0VBL1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tigd2Q0VBL1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tigd2Q0VBL1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tigd2Q0VBL1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tigd2Q0VBL1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tigd2Q0VBL1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tigd2Q0VBL1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tigd2Q0VBL1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tigd2Q0VBL1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tigd2Q0VBL1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tigd2Q0VBL1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tigd2Q0VBL1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tigd2Q0VBL1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tigd2Q0VBL1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tigd2Q0VBL1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tigd2Q0VBL1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tigd2Q0VBL1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tigd2Q0VBL1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tigd2Q0VBL1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tigd2Q0VBL1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tigd2Q0VBL1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tigd2Q0VBL1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tigd2Q0VBL1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tigd2Q0VBL1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tigd2Q0VBL1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tigd2Q0VBL1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tigd2Q0VBL1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms