Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntnap5bQ0V8T8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntnap5bQ0V8T8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntnap5bQ0V8T8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cntnap5bQ0V8T8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cntnap5bQ0V8T8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cntnap5bQ0V8T8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntnap5bQ0V8T8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntnap5bQ0V8T8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntnap5bQ0V8T8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntnap5bQ0V8T8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntnap5bQ0V8T8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntnap5bQ0V8T8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntnap5bQ0V8T8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntnap5bQ0V8T8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntnap5bQ0V8T8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntnap5bQ0V8T8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntnap5bQ0V8T8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntnap5bQ0V8T8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntnap5bQ0V8T8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntnap5bQ0V8T8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntnap5bQ0V8T8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntnap5bQ0V8T8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntnap5bQ0V8T8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntnap5bQ0V8T8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntnap5bQ0V8T8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntnap5bQ0V8T8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntnap5bQ0V8T8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntnap5bQ0V8T8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntnap5bQ0V8T8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntnap5bQ0V8T8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntnap5bQ0V8T8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntnap5bQ0V8T8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntnap5bQ0V8T8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntnap5bQ0V8T8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntnap5bQ0V8T8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntnap5bQ0V8T8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntnap5bQ0V8T8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntnap5bQ0V8T8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntnap5bQ0V8T8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntnap5bQ0V8T8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntnap5bQ0V8T8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntnap5bQ0V8T8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntnap5bQ0V8T8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntnap5bQ0V8T8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms