Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Znf541Q0GGX2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Znf541Q0GGX2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Znf541Q0GGX2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Znf541Q0GGX2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Znf541Q0GGX2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Znf541Q0GGX2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Znf541Q0GGX2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Znf541Q0GGX2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Znf541Q0GGX2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Znf541Q0GGX2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Znf541Q0GGX2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Znf541Q0GGX2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Znf541Q0GGX2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Znf541Q0GGX2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Znf541Q0GGX2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Znf541Q0GGX2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Znf541Q0GGX2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Znf541Q0GGX2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Znf541Q0GGX2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Znf541Q0GGX2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Znf541Q0GGX2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Znf541Q0GGX2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Znf541Q0GGX2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Znf541Q0GGX2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Znf541Q0GGX2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Znf541Q0GGX2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Znf541Q0GGX2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Znf541Q0GGX2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Znf541Q0GGX2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Znf541Q0GGX2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
Znf541Q0GGX2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Znf541Q0GGX2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Znf541Q0GGX2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Znf541Q0GGX2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Znf541Q0GGX2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Znf541Q0GGX2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Znf541Q0GGX2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Znf541Q0GGX2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Znf541Q0GGX2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Znf541Q0GGX2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Znf541Q0GGX2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Znf541Q0GGX2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Znf541Q0GGX2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Znf541Q0GGX2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Znf541Q0GGX2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Znf541Q0GGX2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Znf541Q0GGX2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Znf541Q0GGX2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Znf541Q0GGX2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Znf541Q0GGX2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Znf541Q0GGX2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Znf541Q0GGX2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Znf541Q0GGX2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Znf541Q0GGX2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Znf541Q0GGX2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Znf541Q0GGX2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Znf541Q0GGX2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Znf541Q0GGX2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Znf541Q0GGX2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Znf541Q0GGX2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Znf541Q0GGX2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Znf541Q0GGX2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Znf541Q0GGX2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Znf541Q0GGX2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Znf541Q0GGX2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Znf541Q0GGX2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Znf541Q0GGX2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Znf541Q0GGX2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Znf541Q0GGX2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Znf541Q0GGX2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Znf541Q0GGX2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Znf541Q0GGX2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Znf541Q0GGX2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Znf541Q0GGX2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Znf541Q0GGX2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Znf541Q0GGX2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Znf541Q0GGX2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Znf541Q0GGX2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Znf541Q0GGX2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Znf541Q0GGX2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Znf541Q0GGX2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Znf541Q0GGX2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Znf541Q0GGX2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Znf541Q0GGX2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Znf541Q0GGX2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Znf541Q0GGX2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Znf541Q0GGX2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Znf541Q0GGX2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Znf541Q0GGX2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Znf541Q0GGX2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Znf541Q0GGX2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Znf541Q0GGX2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Znf541Q0GGX2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Znf541Q0GGX2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Znf541Q0GGX2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Znf541Q0GGX2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Znf541Q0GGX2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Znf541Q0GGX2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Znf541Q0GGX2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 196.2 ms