Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cnnm1Q0GA42 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cnnm1Q0GA42 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cnnm1Q0GA42 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cnnm1Q0GA42 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cnnm1Q0GA42 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cnnm1Q0GA42 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cnnm1Q0GA42 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cnnm1Q0GA42 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cnnm1Q0GA42 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cnnm1Q0GA42 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cnnm1Q0GA42 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cnnm1Q0GA42 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cnnm1Q0GA42 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cnnm1Q0GA42 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Cnnm1Q0GA42 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cnnm1Q0GA42 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cnnm1Q0GA42 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Cnnm1Q0GA42 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cnnm1Q0GA42 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cnnm1Q0GA42 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cnnm1Q0GA42 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cnnm1Q0GA42 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cnnm1Q0GA42 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cnnm1Q0GA42 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cnnm1Q0GA42 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cnnm1Q0GA42 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cnnm1Q0GA42 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Cnnm1Q0GA42 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cnnm1Q0GA42 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Cnnm1Q0GA42 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cnnm1Q0GA42 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cnnm1Q0GA42 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cnnm1Q0GA42 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cnnm1Q0GA42 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Cnnm1Q0GA42 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cnnm1Q0GA42 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cnnm1Q0GA42 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cnnm1Q0GA42 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cnnm1Q0GA42 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cnnm1Q0GA42 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cnnm1Q0GA42 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cnnm1Q0GA42 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cnnm1Q0GA42 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cnnm1Q0GA42 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cnnm1Q0GA42 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cnnm1Q0GA42 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cnnm1Q0GA42 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cnnm1Q0GA42 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cnnm1Q0GA42 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cnnm1Q0GA42 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cnnm1Q0GA42 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cnnm1Q0GA42 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cnnm1Q0GA42 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cnnm1Q0GA42 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cnnm1Q0GA42 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cnnm1Q0GA42 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cnnm1Q0GA42 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cnnm1Q0GA42 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Cnnm1Q0GA42 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cnnm1Q0GA42 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cnnm1Q0GA42 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cnnm1Q0GA42 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cnnm1Q0GA42 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cnnm1Q0GA42 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cnnm1Q0GA42 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cnnm1Q0GA42 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cnnm1Q0GA42 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cnnm1Q0GA42 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cnnm1Q0GA42 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cnnm1Q0GA42 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cnnm1Q0GA42 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cnnm1Q0GA42 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cnnm1Q0GA42 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cnnm1Q0GA42 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cnnm1Q0GA42 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cnnm1Q0GA42 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cnnm1Q0GA42 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cnnm1Q0GA42 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cnnm1Q0GA42 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cnnm1Q0GA42 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Cnnm1Q0GA42 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Cnnm1Q0GA42 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cnnm1Q0GA42 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cnnm1Q0GA42 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnnm1Q0GA42 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnnm1Q0GA42 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnnm1Q0GA42 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnnm1Q0GA42 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnnm1Q0GA42 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnnm1Q0GA42 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnnm1Q0GA42 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnnm1Q0GA42 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnnm1Q0GA42 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnnm1Q0GA42 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnnm1Q0GA42 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnnm1Q0GA42 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnnm1Q0GA42 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnnm1Q0GA42 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnnm1Q0GA42 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms