Protein–RNA interactions for Protein: Q08775

Runx2, Runt-related transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx2Q08775 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Runx2Q08775 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Runx2Q08775 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Runx2Q08775 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Runx2Q08775 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Runx2Q08775 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Runx2Q08775 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Runx2Q08775 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Runx2Q08775 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Runx2Q08775 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Runx2Q08775 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Runx2Q08775 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Runx2Q08775 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Runx2Q08775 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Runx2Q08775 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Runx2Q08775 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Runx2Q08775 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Runx2Q08775 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms