Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gata4Q08369 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gata4Q08369 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms