Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnn1Q08091 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnn1Q08091 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnn1Q08091 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnn1Q08091 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnn1Q08091 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnn1Q08091 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnn1Q08091 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnn1Q08091 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnn1Q08091 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnn1Q08091 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnn1Q08091 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnn1Q08091 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnn1Q08091 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnn1Q08091 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnn1Q08091 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnn1Q08091 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnn1Q08091 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnn1Q08091 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnn1Q08091 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnn1Q08091 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnn1Q08091 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnn1Q08091 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnn1Q08091 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnn1Q08091 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnn1Q08091 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnn1Q08091 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnn1Q08091 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms