Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atf4Q06507 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Atf4Q06507 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atf4Q06507 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms