Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox8Q04886 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox8Q04886 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox8Q04886 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox8Q04886 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox8Q04886 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox8Q04886 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox8Q04886 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox8Q04886 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox8Q04886 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox8Q04886 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox8Q04886 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox8Q04886 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox8Q04886 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox8Q04886 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox8Q04886 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox8Q04886 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox8Q04886 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox8Q04886 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox8Q04886 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox8Q04886 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox8Q04886 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox8Q04886 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox8Q04886 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox8Q04886 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox8Q04886 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox8Q04886 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox8Q04886 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox8Q04886 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox8Q04886 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox8Q04886 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox8Q04886 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox8Q04886 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sox8Q04886 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox8Q04886 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox8Q04886 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox8Q04886 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox8Q04886 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox8Q04886 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox8Q04886 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox8Q04886 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox8Q04886 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox8Q04886 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox8Q04886 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox8Q04886 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox8Q04886 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox8Q04886 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox8Q04886 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox8Q04886 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox8Q04886 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox8Q04886 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox8Q04886 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox8Q04886 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox8Q04886 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox8Q04886 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox8Q04886 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox8Q04886 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox8Q04886 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox8Q04886 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox8Q04886 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox8Q04886 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox8Q04886 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox8Q04886 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox8Q04886 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox8Q04886 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox8Q04886 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox8Q04886 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox8Q04886 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox8Q04886 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox8Q04886 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox8Q04886 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox8Q04886 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox8Q04886 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox8Q04886 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox8Q04886 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox8Q04886 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox8Q04886 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox8Q04886 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox8Q04886 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox8Q04886 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sox8Q04886 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sox8Q04886 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sox8Q04886 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox8Q04886 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox8Q04886 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox8Q04886 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox8Q04886 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox8Q04886 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox8Q04886 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox8Q04886 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox8Q04886 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox8Q04886 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox8Q04886 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox8Q04886 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox8Q04886 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox8Q04886 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox8Q04886 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox8Q04886 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox8Q04886 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox8Q04886 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms