Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smpd1Q04519 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smpd1Q04519 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Smpd1Q04519 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smpd1Q04519 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smpd1Q04519 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smpd1Q04519 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smpd1Q04519 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smpd1Q04519 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smpd1Q04519 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smpd1Q04519 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smpd1Q04519 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smpd1Q04519 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smpd1Q04519 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smpd1Q04519 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smpd1Q04519 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smpd1Q04519 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smpd1Q04519 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smpd1Q04519 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smpd1Q04519 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smpd1Q04519 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smpd1Q04519 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smpd1Q04519 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Smpd1Q04519 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Smpd1Q04519 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smpd1Q04519 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smpd1Q04519 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smpd1Q04519 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Smpd1Q04519 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Smpd1Q04519 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smpd1Q04519 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smpd1Q04519 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smpd1Q04519 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smpd1Q04519 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smpd1Q04519 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smpd1Q04519 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smpd1Q04519 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smpd1Q04519 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smpd1Q04519 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smpd1Q04519 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smpd1Q04519 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smpd1Q04519 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smpd1Q04519 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smpd1Q04519 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smpd1Q04519 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smpd1Q04519 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms