Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccl7Q03366 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl7Q03366 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl7Q03366 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl7Q03366 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl7Q03366 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl7Q03366 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl7Q03366 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl7Q03366 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl7Q03366 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl7Q03366 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl7Q03366 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl7Q03366 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl7Q03366 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl7Q03366 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl7Q03366 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl7Q03366 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl7Q03366 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl7Q03366 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl7Q03366 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl7Q03366 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl7Q03366 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl7Q03366 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl7Q03366 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccl7Q03366 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccl7Q03366 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccl7Q03366 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccl7Q03366 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccl7Q03366 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccl7Q03366 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccl7Q03366 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl7Q03366 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl7Q03366 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl7Q03366 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl7Q03366 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl7Q03366 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl7Q03366 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl7Q03366 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl7Q03366 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl7Q03366 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl7Q03366 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl7Q03366 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl7Q03366 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl7Q03366 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl7Q03366 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl7Q03366 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl7Q03366 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl7Q03366 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl7Q03366 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl7Q03366 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl7Q03366 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl7Q03366 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms