Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Thbs2Q03350 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thbs2Q03350 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms