Protein–RNA interactions for Protein: Q02100

SKO1, CRE-binding bZIP protein SKO1, yeastyeast

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SKO1Q02100 YPL062WYPL062W 405 nt4.57□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 SAM4YPL273W 978 nt4.57□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 YPR195CYPR195C 330 nt4.57□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 HRP1YOL123W 1605 nt4.57□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 YOR1YGR281W 4434 nt4.56□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 SIP5YMR140W 1470 nt4.56□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 BRF1YGR246C 1791 nt4.56□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 PAF1YBR279W 1338 nt4.56□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 GAL4YPL248C 2646 nt4.56□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 PHO8YDR481C 1701 nt4.56□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 ASK10YGR097W 3441 nt4.56□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 GET3YDL100C 1065 nt4.56□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 COS7YDL248W 1152 nt4.56□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 YLF2YHL014C 1218 nt4.56□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 COS5YJR161C 1152 nt4.56□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 MSA2YKR077W 1092 nt4.56□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 PNP1YLR209C 936 nt4.56□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 YLR326WYLR326W 723 nt4.56□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 LTO1YNL260C 597 nt4.56□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 GSP2YOR185C 663 nt4.56□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 snR34snR34 203 nt4.56□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 KTR3YBR205W 1215 nt4.56□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 YJR015WYJR015W 1533 nt4.56□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 CAB1YDR531W 1104 nt4.55□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 TDH3YGR192C 999 nt4.55□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 ARD1YHR013C 717 nt4.55□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 ADD66YKL206C 804 nt4.55□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 TPP1YMR156C 717 nt4.55□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 YOR024WYOR024W 324 nt4.55□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 SUI3YPL237W 858 nt4.55□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 HSP26YBR072W 645 nt4.55□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 BSD2YBR290W 966 nt4.55□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 FRE1YLR214W 2061 nt4.55□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 STP4YDL048C 1473 nt4.55□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 SNT2YGL131C 4212 nt4.54□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 DED81YHR019C 1665 nt4.54□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 LAP3YNL239W 1365 nt4.54□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 ZUO1YGR285C 1302 nt4.54□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 RML2YEL050C 1182 nt4.54□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 YGR015CYGR015C 987 nt4.54□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 YIL163CYIL163C 354 nt4.54□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 RAD17YOR368W 1206 nt4.54□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 YPL114WYPL114W 420 nt4.54□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 ATG14YBR128C 1035 nt4.54□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 QDR1YIL120W 1692 nt4.54□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 MLF3YNL074C 1359 nt4.53□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 ALG2YGL065C 1512 nt4.53□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 MCH4YOL119C 1506 nt4.53□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 MED2YDL005C 1296 nt4.53□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 EDC1YGL222C 528 nt4.53□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 POM33YLL023C 840 nt4.53□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 SSO1YPL232W 873 nt4.53□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 PHO12YHR215W 1404 nt4.53□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 PHO11YAR071W 1404 nt4.53□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 KTR7YIL085C 1554 nt4.53□□□□□ -1.69
SKO1Q02100 RNY1YPL123C 1305 nt4.52□□□□□ -1.69
SKO1Q02100 CTS1YLR286C 1689 nt4.52□□□□□ -1.69
SKO1Q02100 DOS2YDR068W 933 nt4.52□□□□□ -1.69
SKO1Q02100 YGR079WYGR079W 1113 nt4.52□□□□□ -1.69
SKO1Q02100 SCW4YGR279C 1161 nt4.52□□□□□ -1.69
SKO1Q02100 YJL068CYJL068C 900 nt4.52□□□□□ -1.69
SKO1Q02100 ELO3YLR372W 1038 nt4.52□□□□□ -1.69
SKO1Q02100 FES1YBR101C 873 nt4.52□□□□□ -1.69
SKO1Q02100 PRP43YGL120C 2304 nt4.52□□□□□ -1.69
SKO1Q02100 FRS1YLR060W 1788 nt4.52□□□□□ -1.69
SKO1Q02100 SNF2YOR290C 5112 nt4.52□□□□□ -1.69
SKO1Q02100 PAL1YDR348C 1500 nt4.51□□□□□ -1.69
SKO1Q02100 FOL1YNL256W 2475 nt4.51□□□□□ -1.69
SKO1Q02100 NDC1YML031W 1968 nt4.51□□□□□ -1.69
SKO1Q02100 KCC4YCL024W 3114 nt4.51□□□□□ -1.69
SKO1Q02100 MCM21YDR318W 1107 nt4.51□□□□□ -1.69
SKO1Q02100 RPA49YNL248C 1248 nt4.51□□□□□ -1.69
SKO1Q02100 PPG1YNR032W 1107 nt4.51□□□□□ -1.69
SKO1Q02100 YOR008W-BYOR008W-B 102 nt4.51□□□□□ -1.69
SKO1Q02100 ETR1YBR026C 1143 nt4.51□□□□□ -1.69
SKO1Q02100 BBP1YPL255W 1158 nt4.51□□□□□ -1.69
SKO1Q02100 YBR219CYBR219C 384 nt4.51□□□□□ -1.69
SKO1Q02100 MDL1YLR188W 2088 nt4.5□□□□□ -1.69
SKO1Q02100 YDR098C-AYDR098C-A 1323 nt4.5□□□□□ -1.69
SKO1Q02100 YDR210C-CYDR210C-C 1323 nt4.5□□□□□ -1.69
SKO1Q02100 YDR261C-CYDR261C-C 1323 nt4.5□□□□□ -1.69
SKO1Q02100 YDR316W-AYDR316W-A 1323 nt4.5□□□□□ -1.69
SKO1Q02100 YDR365W-AYDR365W-A 1323 nt4.5□□□□□ -1.69
SKO1Q02100 YER137C-AYER137C-A 1323 nt4.5□□□□□ -1.69
SKO1Q02100 YER159C-AYER159C-A 1323 nt4.5□□□□□ -1.69
SKO1Q02100 YGR027W-AYGR027W-A 1323 nt4.5□□□□□ -1.69
SKO1Q02100 YGR038C-AYGR038C-A 1323 nt4.5□□□□□ -1.69
SKO1Q02100 YGR161C-CYGR161C-C 1323 nt4.5□□□□□ -1.69
SKO1Q02100 YJR026WYJR026W 1323 nt4.5□□□□□ -1.69
SKO1Q02100 YJR028WYJR028W 1323 nt4.5□□□□□ -1.69
SKO1Q02100 YAR010CYAR010C 1323 nt4.5□□□□□ -1.69
SKO1Q02100 YLR157C-AYLR157C-A 1323 nt4.5□□□□□ -1.69
SKO1Q02100 YLR227W-AYLR227W-A 1323 nt4.5□□□□□ -1.69
SKO1Q02100 YLR256W-AYLR256W-A 1323 nt4.5□□□□□ -1.69
SKO1Q02100 YML040WYML040W 1323 nt4.5□□□□□ -1.69
SKO1Q02100 YML045W-AYML045W-A 1323 nt4.5□□□□□ -1.69
SKO1Q02100 YMR051CYMR051C 1323 nt4.5□□□□□ -1.69
SKO1Q02100 CUS1YMR240C 1311 nt4.5□□□□□ -1.69
SKO1Q02100 YNL054W-AYNL054W-A 1323 nt4.5□□□□□ -1.69
SKO1Q02100 YOL103W-AYOL103W-A 1323 nt4.5□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.1 ms