Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Top2aQ01320 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Top2aQ01320 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Top2aQ01320 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Top2aQ01320 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Top2aQ01320 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Top2aQ01320 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Top2aQ01320 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Top2aQ01320 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Top2aQ01320 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Top2aQ01320 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Top2aQ01320 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Top2aQ01320 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Top2aQ01320 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Top2aQ01320 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Top2aQ01320 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Top2aQ01320 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Top2aQ01320 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Top2aQ01320 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Top2aQ01320 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Top2aQ01320 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Top2aQ01320 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Top2aQ01320 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Top2aQ01320 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Top2aQ01320 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Top2aQ01320 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Top2aQ01320 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Top2aQ01320 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Top2aQ01320 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Top2aQ01320 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Top2aQ01320 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Top2aQ01320 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Top2aQ01320 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Top2aQ01320 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Top2aQ01320 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Top2aQ01320 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Top2aQ01320 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Top2aQ01320 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Top2aQ01320 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Top2aQ01320 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Top2aQ01320 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Top2aQ01320 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Top2aQ01320 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Top2aQ01320 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Top2aQ01320 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Top2aQ01320 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Top2aQ01320 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Top2aQ01320 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Top2aQ01320 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Top2aQ01320 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Top2aQ01320 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Top2aQ01320 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Top2aQ01320 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Top2aQ01320 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Top2aQ01320 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Top2aQ01320 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Top2aQ01320 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Top2aQ01320 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Top2aQ01320 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Top2aQ01320 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Top2aQ01320 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Top2aQ01320 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Top2aQ01320 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
Top2aQ01320 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.93
Top2aQ01320 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Top2aQ01320 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Top2aQ01320 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Top2aQ01320 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Top2aQ01320 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Top2aQ01320 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Top2aQ01320 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Top2aQ01320 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Top2aQ01320 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Top2aQ01320 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Top2aQ01320 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Top2aQ01320 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Top2aQ01320 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Top2aQ01320 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Top2aQ01320 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Top2aQ01320 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Top2aQ01320 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Top2aQ01320 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Top2aQ01320 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Top2aQ01320 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Top2aQ01320 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Top2aQ01320 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Top2aQ01320 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Top2aQ01320 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Top2aQ01320 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Top2aQ01320 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Top2aQ01320 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Top2aQ01320 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Top2aQ01320 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Top2aQ01320 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Top2aQ01320 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Top2aQ01320 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Top2aQ01320 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Top2aQ01320 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Top2aQ01320 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Top2aQ01320 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms