Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbp1Q00915 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbp1Q00915 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms