Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbp4Q00724 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbp4Q00724 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp4Q00724 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.5 ms