Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scn1bP97952 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms