Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cry1P97784 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cry1P97784 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cry1P97784 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cry1P97784 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cry1P97784 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cry1P97784 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cry1P97784 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cry1P97784 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cry1P97784 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cry1P97784 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cry1P97784 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cry1P97784 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cry1P97784 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cry1P97784 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cry1P97784 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cry1P97784 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cry1P97784 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cry1P97784 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cry1P97784 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cry1P97784 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cry1P97784 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cry1P97784 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cry1P97784 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cry1P97784 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cry1P97784 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cry1P97784 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cry1P97784 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cry1P97784 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cry1P97784 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cry1P97784 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cry1P97784 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cry1P97784 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cry1P97784 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cry1P97784 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cry1P97784 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cry1P97784 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cry1P97784 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cry1P97784 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cry1P97784 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cry1P97784 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cry1P97784 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cry1P97784 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cry1P97784 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cry1P97784 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cry1P97784 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cry1P97784 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cry1P97784 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cry1P97784 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms