Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lig3P97386 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lig3P97386 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lig3P97386 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lig3P97386 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lig3P97386 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lig3P97386 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lig3P97386 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lig3P97386 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lig3P97386 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lig3P97386 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lig3P97386 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lig3P97386 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lig3P97386 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lig3P97386 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lig3P97386 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Lig3P97386 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lig3P97386 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lig3P97386 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lig3P97386 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lig3P97386 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lig3P97386 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lig3P97386 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lig3P97386 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lig3P97386 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lig3P97386 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lig3P97386 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lig3P97386 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Lig3P97386 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lig3P97386 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lig3P97386 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lig3P97386 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lig3P97386 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lig3P97386 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lig3P97386 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lig3P97386 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lig3P97386 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lig3P97386 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lig3P97386 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lig3P97386 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lig3P97386 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lig3P97386 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lig3P97386 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lig3P97386 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lig3P97386 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lig3P97386 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lig3P97386 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lig3P97386 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lig3P97386 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lig3P97386 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lig3P97386 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lig3P97386 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lig3P97386 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lig3P97386 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lig3P97386 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lig3P97386 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Lig3P97386 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lig3P97386 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lig3P97386 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms